Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms