Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MCCC2Q9HCC0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms