Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.1 ms