Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms