Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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FOXQ1Q9C009 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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FOXQ1Q9C009 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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FOXQ1Q9C009 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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