Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms