Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms