Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms