Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
REPIN1Q9BWE0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 RTN1-203ENST00000395090 1609 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms