Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAF4Q9BUZ4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAF4Q9BUZ4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms