Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms