Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

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Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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