Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms