Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms