Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms