Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms