Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms