Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms