Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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EP400Q96L91 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
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EP400Q96L91 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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EP400Q96L91 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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EP400Q96L91 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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EP400Q96L91 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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EP400Q96L91 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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EP400Q96L91 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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EP400Q96L91 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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