Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A2Q96JW4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms