Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DCHS1Q96JQ0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms