Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAMP1Q96JM3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms