Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms