Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGAM5Q96HS1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGAM5Q96HS1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGAM5Q96HS1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGAM5Q96HS1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGAM5Q96HS1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGAM5Q96HS1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGAM5Q96HS1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PGAM5Q96HS1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGAM5Q96HS1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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