Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCARF2Q96GP6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARF2Q96GP6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms