Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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RNF185Q96GF1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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RNF185Q96GF1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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RNF185Q96GF1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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RNF185Q96GF1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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RNF185Q96GF1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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RNF185Q96GF1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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RNF185Q96GF1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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RNF185Q96GF1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RNF185Q96GF1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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