Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms