Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDC3Q96F86 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms