Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC97Q96F63 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms