Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms