Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TM4SF18Q96CE8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms