Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms