Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDAQ92838 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EDAQ92838 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EDAQ92838 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDAQ92838 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDAQ92838 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDAQ92838 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDAQ92838 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDAQ92838 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDAQ92838 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDAQ92838 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDAQ92838 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDAQ92838 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EDAQ92838 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms