Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms