Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RGP1Q92546 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms