Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRIPQ8WXE1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms