Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNRF4Q8WWF5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms