Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE6

TMEM171, Transmembrane protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM171Q8WVE6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM171Q8WVE6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms