Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF3IP1Q8TDR0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms