Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BRSK1Q8TDC3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BRSK1Q8TDC3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BRSK1Q8TDC3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BRSK1Q8TDC3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRSK1Q8TDC3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRSK1Q8TDC3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRSK1Q8TDC3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRSK1Q8TDC3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRSK1Q8TDC3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRSK1Q8TDC3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRSK1Q8TDC3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRSK1Q8TDC3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms