Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX3LQ8TDB6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX3LQ8TDB6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX3LQ8TDB6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX3LQ8TDB6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX3LQ8TDB6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX3LQ8TDB6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX3LQ8TDB6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX3LQ8TDB6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX3LQ8TDB6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms