Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHZ7

MBD3L2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L2Q8NHZ7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L2Q8NHZ7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms