Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms