Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC191Q8NCU4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC191Q8NCU4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms