Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APCDD1LQ8NCL9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APCDD1LQ8NCL9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APCDD1LQ8NCL9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms