Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC71Q8IV32 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC71Q8IV32 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC71Q8IV32 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC71Q8IV32 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC71Q8IV32 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC71Q8IV32 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC71Q8IV32 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC71Q8IV32 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC71Q8IV32 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC71Q8IV32 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC71Q8IV32 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC71Q8IV32 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC71Q8IV32 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC71Q8IV32 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC71Q8IV32 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC71Q8IV32 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC71Q8IV32 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC71Q8IV32 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC71Q8IV32 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC71Q8IV32 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC71Q8IV32 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC71Q8IV32 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC71Q8IV32 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC71Q8IV32 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms