Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMC1Q7Z7K0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMC1Q7Z7K0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms