Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WDR53Q7Z5U6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms