Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT28Q7Z3Y7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms