Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
USP43Q70EL4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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